1、首先南瓜发芽需要的最适温度为28~30℃，有条件的可用恒温培养箱进行恒温催芽，将经浸种后的种子用湿布包好，放入28~30℃恒温箱内即可。
2、南瓜种子可以使用电热毯催芽，将能正常使用的电热毯平铺放好，电热毯下可垫一层棉被等物以利保温。
3、然后将准备好的塑料薄膜平铺电热毯上。
4、将用于催芽的毛巾等经开水消毒后，用手拧干（手拧毛巾时不滴水但手指间有水渗出为宜），铺放在塑料薄膜上，将浸种消毒后的南瓜种子稍沥干，平铺在毛巾。
5、铺放在塑料薄膜上，将浸种消毒后的南瓜种子稍沥干，平铺在毛巾。
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